紧急避孕药是在无保护性措施下可以偶尔采用的紧急避孕方法，但绝不可作为一种常规的避孕方法。如果反复、经常服用紧急避孕药，可能会干扰抑制女性排卵。如果在短期内服用，还可能出现内分泌失调，但相当一部分女性由于对紧急避孕药的副作用不了解，盲目、长期、大量服用，导致药效降低，出现月经紊乱，甚至闭经，甚至可能影响到正常卵巢功能。反复、长期滥用紧急避孕药，还极易出现意外妊娠，人流次数越多，危害越大，轻则损伤宫颈、子宫内膜及子宫肌层，重则丧失生育能力。
紧急避孕药并非100%能保证绝对避孕成功，其中也可能有一部分出现避孕失败。紧急避孕药在一个月经周期里只能服用一次，对服药后的性生活无避孕作用。服用方法、次数和说明上，不同的品牌的紧急避孕药也各有不同，需针对个体情况，因人而异。如果不根据使用方法滥用，还可能出现避孕失败、意外妊娠等情况。
在国外，紧急避孕药必须在医生或药师的指导下使用，而且只能作为事后的补救，并非主流用药。在德国、韩国和日本等，除了必须持处方购买外，有的还需要女性上医院就诊。但目前在中国，购买紧急避孕药并不需要处方。再加上，现在的紧急避孕药广告铺天盖地，很多年轻女性就是因为广告中对其效应的夸大宣传才去购买。目前，紧急避孕药的有效率在85%左右，低于短效口服避孕药的99%和安全套的95%，且在短期内频繁使用次数越多，有效率越低。
有业内人士指出，针对紧急避孕药这样将药物当消费品宣传、对药物副作用避而不谈的广告，监管力度还远远不够。建议有关部门可先将紧急避孕药管起来，比如作为处方药销售，同时抓紧对药师培训。数年后，等到所有药师都能准确进行避孕咨询，再将它恢复为非处方药。
广告里说的72小时紧急避孕，是指必须在性生活后72小时内服用，服用越晚，效果越差。但很多女性误以为只要在吃药后72小时内过性生活，就不会怀孕。临床上，因为这样错误用药而意外妊娠的女性非常多。如果女性已经服用了紧急避孕药，应注意如服药后呕吐的话，应在两小时内补一颗药。可先吃几块饼干、喝些牛奶避免呕吐。如果过量过频用药可能导致闭经，点滴出血超过10天者，必须及时就诊。如果有血栓家族史、心血管疾病、糖尿病、乳腺癌患者、产后半年内的哺乳妇女及已怀孕的女性，最好慎用或禁用此药。
